release: prepare Desktop 0.13.12 and Agent 0.13.3

Complete the pending Supervisor changes with opt-in execution, incremental automatic reviews, and activity history. Preserve saved preferences and plans, skip model calls for unchanged input, and keep full replay and cancellation limitations explicit.

Update both release versions, bilingual notes, feature matrices, migration fixtures, and validation evidence. Clear stale browser errors after a successful close retry. Focused validation passed 690 tests across 35 files, plus notes verification, typecheck, and lint; full CI and native release acceptance remain pending. No local production build or packaging was run.

Release note: Enable Supervisor to review work, trace story graphs, and inspect manual or automatic activity without repeating model calls for unchanged input. Desktop 0.13.12 and Agent 0.13.3 also prepare idle remote Runtime cleanup and retirement of replaced Agents; update Desktop before the Host environment. Database upgrades require a pre-upgrade backup for rollback.

docs/features/application-tool-navigation/logic-design.md

@@ -16,7 +16,7 @@
 2. 运行记录不进入工具注册表、应用显隐设置或插件市场。
 3. 文件浏览器、终端、浏览器和资源监控始终是系统工具，不能卸载或被插件替换。
 4. 左下角提供应用中心和独立固定设置入口；文件、终端、浏览器、资源监控只通过右侧工作栏 Tab 和“+”访问，不进入应用中心。
-5. 四个内置应用共享保存顺序。知识库和智能心跳始终启用并常驻，位置可调整；魔法笔记、本机推理监控可独立设置启用和常驻。取消常驻不关闭功能，关闭不删除数据或导航偏好。
+5. 四个内置应用共享保存顺序。知识库始终启用并常驻，位置可调整；智能心跳、魔法笔记、本机推理监控可独立设置启用和常驻。取消常驻不关闭功能，关闭不删除数据或导航偏好。
 6. 入口不能扩大执行空间、文件、PTY、网络或浏览器权限。
 7. 应用中心始终可达，点击向上展开无模态遮罩的锚定菜单，只列已启用应用，不使用打开历史或常驻过滤。菜单底部“管理应用”打开既有 Modal，关闭的可选应用在其中仍可搜索、配置和重新开启。
 8. 所有入口和新请求的功能判断读取同一份保存成功的权威设置；保存中的目标值不提前生效。
@@ -32,13 +32,13 @@ type NavigationContribution =
     }
   | {
       type: 'application'
-      id: 'knowledge' | 'heartbeat'
+      id: 'knowledge'
       source: 'builtin'
       alwaysShown: true
     }
   | {
       type: 'application'
-      id: 'magic-notes' | 'local-inference'
+      id: 'magic-notes' | 'heartbeat' | 'local-inference'
       source: 'builtin'
       enabled: boolean
       pinned: boolean
@@ -59,7 +59,7 @@ type NavigationContribution =
 
 ```text
 当前对话
-应用（按保存顺序；知识库和智能心跳始终显示，可选应用仅显示启用且常驻项）
+应用（按保存顺序；知识库始终显示，可选应用仅显示启用且常驻项）
 运行记录
 ```
 
@@ -70,7 +70,7 @@ type NavigationContribution =
 
 ### 3.1 应用可见性与业务状态
 
-下表仅适用于可选应用。知识库和智能心跳始终可用，管理 Modal 中提供“打开”和排序，保留原工作区实际配置，不增加启用、常驻开关或通用空设置页。心跳单条计划 enabled 仍按原业务规则控制计划。
+下表适用于智能心跳、魔法笔记和本机推理监控。知识库始终可用，管理 Modal 中提供“打开”和排序，保留原工作区实际配置，不增加启用、常驻开关或通用空设置页。心跳应用的默认值与执行条件见[应用启停与执行](../conversation-supervision/logic-design.md#应用启停与执行)。
 
 | 常驻偏好 | 功能启用 | 结果 |
 | --- | --- | --- |
@@ -85,7 +85,7 @@ type NavigationContribution =
 
 ### 3.2 关闭应用与恢复
 
-关闭与恢复仅适用于可选应用，知识库页面、会话控件及关联，以及智能心跳入口、页面和计划 enabled 不受可选应用偏好影响。
+关闭与恢复适用于可选应用，知识库页面、会话控件及关联不受影响。智能心跳关闭后的调度、手动请求、侧栏与在途运行按[应用启停与执行](../conversation-supervision/logic-design.md#应用启停与执行)处理，保留单条计划 enabled。
 
 | 对象 | 关闭后的结果 | 重新开启后的结果 |
 | --- | --- | --- |
@@ -101,7 +101,7 @@ type NavigationContribution =
 编辑同一配置。启用、常驻、显示未完成待办数量分别控制功能、导航和徽标，不保留重复的
 “显示魔法笔记入口”开关。
 
-未配置的应用启用及魔法笔记相关布尔项默认开启；魔法笔记默认常驻，本机推理监控默认不常驻，仍可从应用菜单及管理 Modal 打开。已有保存的 `true` 和 `false` 均保留。
+未配置的魔法笔记、本机推理监控启用及魔法笔记相关布尔项默认开启；心跳应用默认关闭。魔法笔记和心跳默认常驻，本机推理监控默认不常驻；已启用应用仍可从应用菜单及管理 Modal 打开。已有保存的 `true` 和 `false` 均保留。
 AI 评论方式和评论形式继续为单选，沿用现有默认值“即时”和“长评 + 要点”，不能解释为
 全部模式同时启用。迁移保留既有单选值及业务数据。关闭数量显示只隐藏徽标，不修改待办。
 
@@ -183,7 +183,7 @@ warming/loading/live/partial/error -> inactive
 | 固定入口不变量 | FR-1、FR-2 | US-A1、US-A2 |
 | 应用常驻和失败恢复 | FR-3、FR-4、FR-11、FR-12 | US-B1、US-B2、US-B4、US-B5 |
 | 应用中心、常驻顺序 | FR-3、FR-4、FR-5、FR-11、FR-12；PRD 第 8 节 | US-B6、US-B7 |
-| 可选应用启用恢复、知识库和智能心跳固定可用 | FR-3、FR-4、FR-12；PRD 第 8 节补充要求 | US-B8 |
+| 可选应用启用恢复、知识库固定可用 | FR-3、FR-4、FR-12；PRD 第 8 节补充要求 | US-B8 |
 | 魔法笔记迁移及共同配置 | FR-11、FR-12；PRD 第 8 节补充要求 | US-B9 |
 | 工具打开决策表 | FR-6 至 FR-10 | US-C1 至 US-C7 |
 | 资源采样状态 | FR-9 | US-C6 |
@@ -199,7 +199,7 @@ User Stories 已同步上述入口规则，工具实例行为沿用右侧工作
 ## 7. 逻辑完整性评估
 
 首期覆盖应用中心访问、启用与常驻组合、顺序恢复、默认值与旧值迁移、共同设置、保存失败、
-知识库和智能心跳固定入口、可选应用已打开页面恢复，以及右侧实例选择、本机 Home、托管 SSH、无会话、
+知识库固定入口、心跳应用启停、可选应用已打开页面恢复，以及右侧实例选择、本机 Home、托管 SSH、无会话、
 目录失效、资源部分可用与采样停止。工具内部取消、超时、连接恢复及业务后台生命周期由
 相应功能负责，本功能不复制状态机。底部入口打开轻量菜单，“管理应用”才进入与设置相同的整窗 Modal。实现与验证的剩余范围见[实施进度](./progress.md)。